1. Март 2002 — письмо из администрации президента с требованием «освободить занимаемые площади» в административном здании по ул. Московская, 18, где НИСЭПИ арендовал помещение в течение 7 лет.
2. Сентябрь 2003 — первое официальное предупреждение НИСЭПИ Министерством юстиции «О нарушении ст. 26 Закона «Об общественных объединениях» (за несоответствие юридического адреса фактическому)
3. Октябрь 2004 — вызов проф. О. Манаева к министру юстиции по поводу нарушений НИСЭПИ Закона «Об общественных объединениях»
4. Ноябрь 2004 — второе официальное предупреждение НИСЭПИ Министерством юстиции «О нарушении ст. 26 Закона «Об общественных объединениях» (за отказ предоставить копию заполненной анкеты опроса общественного мнения)
5. Ноябрь 2004 — вызов проф. О. Манаева в Республиканскую прокуратуру по поводу проведения экзит-пола во время конституционного референдума в октябре 2004
6. Декабрь 2004 — ночной обыск КГБ в квартире, где проходили встречи сотрудников НИСЭПИ
7. Январь 2005 — процесс «НИСЭПИ против Минюста» в Верховном Суде
8. Апрель 2005 — ликвидация РОО НИСЭПИ Верховным Судом по иску Минюста по ст. 57 Гражданского кодекса
9. Август 2005 — вызов проф. О. Манаева в Управление массовых мероприятий ГУВД г. Минска по поводу проведения брифинга НИСЭПИ в посольстве Литвы
10. Декабрь 2005 — вызов проф. О. Манаева в Республиканскую прокуратуру и вручение первого официального предупреждения «О недопустимости нарушения Закона» (нарушение законодательства о выборах, ст. 167-3 Кодекса об административных правонарушениях)
11. Январь 2006 — приостановление деятельности РОО «Белорусские фабрики мысли» Верховным Судом по иску Минюста
12. Июнь 2006 — вызов проф. О. Манаева в Республиканскую прокуратуру и вручение второго официального предупреждения «О недопустимости нарушения Закона» (ст. 369-1 Уголовного Кодекса «Дискредитация Республики Беларусь», предусматривающая до двух лет лишения свободы)
13. Август 2006 — ликвидация РОО «Белорусские фабрики мысли» Верховным Судом по иску Минюста
14. Апрель 2007 — вызов проф. О. Манаева в Генеральную прокуратуру по поводу проведения научно-практической конференции «Беларусь и «большая Европа» и последующих публикаций в независимой прессе
15. Июль 2008 — требование Комитета госконтроля проф. О. Манаеву «в течение 5-ти дней предоставить сведения о доходах и имуществе» за последние два года и предупреждение, «что при не исполнении настоящего предписания к Вам будут применены меры воздействия в соответствии с требованиями действующего законодательства РБ»
16. Октябрь 2009 — требование Министерства по налогам и сборам проф. О. Манаеву «как руководителю ОО «Белорусские фабрики мысли» представить документы по деятельности организации, а также регистры бухгалтерского и налогового учета», несмотря на то, что данная организация была ликвидирована Верховным Судом по иску Минюста в августе 2006 г.
17. Mай 2010 — вызов проф. О. Манаева в Министерство по налогам и сборам «по вопросу соблюдения налогового законодательства с представлением соответствующих документов за период с 2000 г.»
18. Июнь 2010 — руководство Белорусского государственного университета (в лице ректора академика С. Абламейко и проректора проф. В. Клюни) по указанию КГБ потребовало от проф. О. Манаева «в течение десяти дней подать заявление об увольнении «по соглашению сторон», несмотря на то, что он работает в БГУ (с учетом времени обучения) 40 лет, а до выхода на пенсию ему осталось полтора года